GEO2Enrichr5.0

简介:
玛雅实验室差异表达基因的鉴定是从基因表达谱研究中提取知识的重要步骤。来自微阵列和其他高通量技术的原始扩增数据存入基因扩增综合 (GEO) 并作为文本中的简单综合格式 (SOFT) 文件使用。然而，从 GEO 中提取和分析差异表达的基因需要大量的计算技能。 GEO2Enrichr 是一个浏览器扩展，可用于从 GEO 中提取差异表达的基因集，并通过用户界面使用 Enrichr 分析这些集。 GEO2Enrichr 为 GEO 网页添加了功能，用户只需单击一下，就可以将两组样本提交到我们的网络服务器。服务器下载 SOFT 文件，解析、清理和标准化数据，识别差异表达的基因，然后将生成的基因列表通过管道传输到 Enrichr 进行下游功能分析。 GEO2Enrichr 可以帮助研究人员在没有技术开销的情况下快速探索假设，通过自动化从主要存储库 GEO 中提取知识所需的数据处理步骤，降低生物学家的进入门槛。